Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTGIRP43119 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms