Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HOXD12P35452 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXD12P35452 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms