Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP6P35125 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP6P35125 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP6P35125 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP6P35125 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP6P35125 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP6P35125 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP6P35125 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP6P35125 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP6P35125 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP6P35125 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP6P35125 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms