Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms