Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CD40LGP29965 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CD40LGP29965 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms