Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GTF2E1P29083 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF2E1P29083 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms