Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE4AP27815 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4AP27815 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms