Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCEA1P23193 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms