Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCNA2P20248 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms