Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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PTPRAP18433 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PTPRAP18433 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRAP18433 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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