Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPI1P17947 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPI1P17947 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPI1P17947 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms