Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GP1BBP13224 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GP1BBP13224 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms