Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
VPREB1P12018 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
VPREB1P12018 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms