Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CETPP11597 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CETPP11597 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CETPP11597 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms