Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GIMD1P0DJR0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms