Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC166P0CW27 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms