Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CT47B1P0C2W7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CT47B1P0C2W7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms