Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYCNP04198 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MYCNP04198 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYCNP04198 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYCNP04198 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
MYCNP04198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MYCNP04198 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms