Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HLA-DQB1P01920 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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