Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTP4A3O75365 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTP4A3O75365 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms