Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIN3BO75182 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIN3BO75182 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms