Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GMDSO60547 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GMDSO60547 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms