Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OIP5O43482 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OIP5O43482 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms