Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIAH2O43255 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms