Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms