Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms