Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
USP17L12C9JPN9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP17L12C9JPN9 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms