Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms