Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
WASHC1A8K0Z3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms