Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF316A6NFI3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF316A6NFI3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms