Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GOLGA6L4A6NEF3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GOLGA6L4A6NEF3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms