Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MBD3L3A6NE82 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms