Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PSDA5PKW4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PSDA5PKW4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms