Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00312Q9Y6C7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00312Q9Y6C7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00312Q9Y6C7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms