Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX8Q9Y5X2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX8Q9Y5X2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX8Q9Y5X2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SNX8Q9Y5X2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms