Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NFE2L3Q9Y4A8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NFE2L3Q9Y4A8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NFE2L3Q9Y4A8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NFE2L3Q9Y4A8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms