Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y466

NR2E1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E1Q9Y466 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR2E1Q9Y466 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR2E1Q9Y466 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR2E1Q9Y466 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NR2E1Q9Y466 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NR2E1Q9Y466 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms