Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SF3B6Q9Y3B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SF3B6Q9Y3B4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms