Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRELID3BQ9Y3B1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRELID3BQ9Y3B1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRELID3BQ9Y3B1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms