Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZDHHC9Q9Y397 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZDHHC9Q9Y397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZDHHC9Q9Y397 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZDHHC9Q9Y397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZDHHC9Q9Y397 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms