Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFT52Q9Y366 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT52Q9Y366 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IFT52Q9Y366 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms