Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF13Q9Y2Y9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF13Q9Y2Y9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF13Q9Y2Y9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KLF13Q9Y2Y9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KLF13Q9Y2Y9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLF13Q9Y2Y9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLF13Q9Y2Y9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms