Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP8A1Q9Y2Q0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP8A1Q9Y2Q0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms