Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITM2BQ9Y287 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITM2BQ9Y287 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITM2BQ9Y287 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms