Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALD1Q9ULE6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PALD1Q9ULE6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PALD1Q9ULE6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PALD1Q9ULE6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PALD1Q9ULE6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PALD1Q9ULE6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PALD1Q9ULE6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms