Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RARRES3Q9UL19 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RARRES3Q9UL19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RARRES3Q9UL19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms