Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SMPXQ9UHP9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SMPXQ9UHP9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMPXQ9UHP9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms