Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CGGBP1Q9UFW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CGGBP1Q9UFW8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CGGBP1Q9UFW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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