Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NXF1Q9UBU9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NXF1Q9UBU9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NXF1Q9UBU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms