Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SAE1Q9UBE0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SAE1Q9UBE0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SAE1Q9UBE0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SAE1Q9UBE0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms